Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.88e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 RAB24-205ENST00000471466 1642 ntTSL 519.81■□□□□ 0.768e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.538e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 DHX34-202ENST00000460681 1838 ntTSL 518.15■□□□□ 0.58e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.088e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-16■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 514.45□□□□□ -0.11e-16■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-16■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 VPS33B-208ENST00000574755 2356 ntTSL 213.49□□□□□ -0.258e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.348e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.358e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.368e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.448e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.638e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.978e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.088e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 MAP7D3-205ENST00000471510 671 ntTSL 35.79□□□□□ -1.488e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 VPS33B-207ENST00000557470 529 ntTSL 55.42□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 DHRS4-AS1-205ENST00000556379 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 57.4
PUM2Q8TB72 CAB39-207ENST00000614925 1619 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-19■■■■■ 57.3
PUM2Q8TB72 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15□□□□□ -0.011e-41■■■■■ 57.2
PUM2Q8TB72 HIST1H3J-202ENST00000479986 522 ntTSL 220.25■□□□□ 0.831e-323■■■■■ 57.2
PUM2Q8TB72 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 57.1
PUM2Q8TB72 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 57.1
PUM2Q8TB72 MSL1-209ENST00000582884 580 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 57.1
PUM2Q8TB72 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.931e-6■■■■■ 57
PUM2Q8TB72 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 57
PUM2Q8TB72 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 57
PUM2Q8TB72 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 56.9
PUM2Q8TB72 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 56.9
PUM2Q8TB72 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 56.9
PUM2Q8TB72 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 56.9
PUM2Q8TB72 KLHL20-201ENST00000209884 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.837e-35■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 KLHL20-204ENST00000488983 669 ntTSL 25.5□□□□□ -1.537e-35■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-206ENST00000405218 3391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.96e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.166e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.36e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.546e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.556e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.716e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.756e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.86e-14■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 WAPL-204ENST00000484070 3207 ntTSL 26.57□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 56.8
PUM2Q8TB72 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 56.7
PUM2Q8TB72 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 56.7
PUM2Q8TB72 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 56.7
PUM2Q8TB72 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 56.7
PUM2Q8TB72 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 326.14■■□□□ 1.785e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.685e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SH3GL3-205ENST00000563901 1647 ntTSL 1 (best)25.48■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 RNF19A-211ENST00000523167 792 ntTSL 423.69■■□□□ 1.385e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-239ENST00000583859 567 ntTSL 523.49■■□□□ 1.355e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-214ENST00000533998 581 ntTSL 323.35■■□□□ 1.335e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)22.89■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ZIC2-204ENST00000481565 218 ntTSL 222.86■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.225e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.215e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.165e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.045e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-212ENST00000533383 982 ntTSL 521.19■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-207ENST00000582048 554 ntTSL 321.03■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.925e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.855e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.835e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SETD3-203ENST00000357563 2191 ntTSL 520.21■□□□□ 0.835e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 220.21■□□□□ 0.835e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLIT1-205ENST00000456008 948 ntTSL 320.06■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CASC4-204ENST00000557945 1386 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.795e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-210ENST00000585293 702 ntTSL 319.87■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-214ENST00000456441 582 ntTSL 319.27■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 EPS15L1-206ENST00000594851 681 ntTSL 319.09■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-209ENST00000584207 738 ntTSL 319.04■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 CASC4-203ENST00000429162 1918 ntTSL 219■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-208ENST00000584118 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.89■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 218.84■□□□□ 0.615e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 TRAPPC12-220ENST00000482645 1538 ntTSL 218.66■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 518.58■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 MMP11-204ENST00000437086 2071 ntTSL 218.4■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 56.5
PUM2Q8TB72 FNTA-206ENST00000527153 582 ntTSL 318.34■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 56.5
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 204.4 ms