RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481565.1

ZIC2-204, Transcript of Zic family member 2, humanhuman

TSL 2

Gene ZIC2, Length 218 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2-204ENST00000481565 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.48■■■■■ 7.43
ZIC2-204ENST00000481565 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.85■■■■■ 6.37
ZIC2-204ENST00000481565 ABCC9O60706 1549 aa54.26■■■■■ 6.28
ZIC2-204ENST00000481565 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.93■■■■■ 5.9
ZIC2-204ENST00000481565 NACADO15069 1562 aa51.74■■■■■ 5.87
ZIC2-204ENST00000481565 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.66■■■■■ 5.86
ZIC2-204ENST00000481565 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.24■■■■■ 5.79
ZIC2-204ENST00000481565 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
ZIC2-204ENST00000481565 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.82■■■■■ 5.73
ZIC2-204ENST00000481565 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.65■■■■■ 5.7
ZIC2-204ENST00000481565 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.64■■■■■ 5.7
ZIC2-204ENST00000481565 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.36■■■■■ 5.65
ZIC2-204ENST00000481565 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.31■■■■■ 5.64
ZIC2-204ENST00000481565 SCRIBQ14160 1630 aa50.03■■■■■ 5.6
ZIC2-204ENST00000481565 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.8■■■■■ 5.56
ZIC2-204ENST00000481565 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
ZIC2-204ENST00000481565 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.02■■■■■ 5.44
ZIC2-204ENST00000481565 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.82■■■■■ 5.41
ZIC2-204ENST00000481565 SMARCA4P51532 1647 aa47.8■■■■■ 5.24
ZIC2-204ENST00000481565 NCAPD3P42695 1498 aa47.77■■■■■ 5.24
ZIC2-204ENST00000481565 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.71■■■■■ 5.23
ZIC2-204ENST00000481565 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.69■■■■■ 5.22
ZIC2-204ENST00000481565 SMARCA2P51531 1590 aa47.62■■■■■ 5.21
ZIC2-204ENST00000481565 HMGXB3Q12766 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
ZIC2-204ENST00000481565 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.37■■■■■ 5.17
ZIC2-204ENST00000481565 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.33■■■■■ 5.17
ZIC2-204ENST00000481565 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
ZIC2-204ENST00000481565 ERCC6Q03468 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
ZIC2-204ENST00000481565 WIZO95785 1651 aa46.81■■■■■ 5.08
ZIC2-204ENST00000481565 NESP48681 1621 aa46.78■■■■■ 5.08
ZIC2-204ENST00000481565 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.65■■■■■ 5.06
ZIC2-204ENST00000481565 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.57■■■■■ 5.05
ZIC2-204ENST00000481565 CUX2O14529 1486 aa46.51■■■■■ 5.04
ZIC2-204ENST00000481565 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.36■■■■■ 5.01
ZIC2-204ENST00000481565 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.32■■■■■ 5.01
ZIC2-204ENST00000481565 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
ZIC2-204ENST00000481565 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
ZIC2-204ENST00000481565 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.15■■■■■ 4.98
ZIC2-204ENST00000481565 CFTRP13569 1480 aa45.95■■■■■ 4.95
ZIC2-204ENST00000481565 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.87■■■■■ 4.93
ZIC2-204ENST00000481565 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.82■■■■■ 4.93
ZIC2-204ENST00000481565 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.81■■■■■ 4.92
ZIC2-204ENST00000481565 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.77■■■■■ 4.92
ZIC2-204ENST00000481565 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.75■■■■■ 4.91
ZIC2-204ENST00000481565 WDR62O43379 1518 aa45.7■■■■■ 4.91
ZIC2-204ENST00000481565 PRDM2Q13029 1718 aa45.46■■■■■ 4.87
ZIC2-204ENST00000481565 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
ZIC2-204ENST00000481565 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
ZIC2-204ENST00000481565 TOPBP1Q92547 1522 aa45.01■■■■■ 4.8
ZIC2-204ENST00000481565 ABCC8Q09428 1581 aa44.99■■■■■ 4.79
ZIC2-204ENST00000481565 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.9■■■■■ 4.78
ZIC2-204ENST00000481565 IFT140Q96RY7 1462 aa44.88■■■■■ 4.78
ZIC2-204ENST00000481565 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
ZIC2-204ENST00000481565 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.59■■■■■ 4.73
ZIC2-204ENST00000481565 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
ZIC2-204ENST00000481565 OSCARQ8IYS5 282 aa44.52■■■■■ 4.72
ZIC2-204ENST00000481565 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
ZIC2-204ENST00000481565 CUX1P39880 1505 aa44.47■■■■■ 4.71
ZIC2-204ENST00000481565 SOGA1O94964 1423 aa44.43■■■■■ 4.7
ZIC2-204ENST00000481565 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.42■■■■■ 4.7
ZIC2-204ENST00000481565 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.42■■■■■ 4.7
ZIC2-204ENST00000481565 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
ZIC2-204ENST00000481565 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
ZIC2-204ENST00000481565 WDR97A6NE52 1622 aa44.16■■■■■ 4.66
ZIC2-204ENST00000481565 FBLN2P98095 1184 aa44.03■■■■■ 4.64
ZIC2-204ENST00000481565 TRIM41Q8WV44 630 aa44.03■■■■■ 4.64
ZIC2-204ENST00000481565 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44■■■■■ 4.63
ZIC2-204ENST00000481565 CHD1O14646 1710 aa44■■■■■ 4.63
ZIC2-204ENST00000481565 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.98■■■■■ 4.63
ZIC2-204ENST00000481565 GRIN2BQ13224 1484 aa43.97■■■■■ 4.63
ZIC2-204ENST00000481565 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.95■■■■■ 4.63
ZIC2-204ENST00000481565 TOP2BQ02880 1626 aa43.92■■■■■ 4.62
ZIC2-204ENST00000481565 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.91■■■■■ 4.62
ZIC2-204ENST00000481565 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.9■■■■■ 4.62
ZIC2-204ENST00000481565 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
ZIC2-204ENST00000481565 SYNJ1O43426 1573 aa43.89■■■■■ 4.62
ZIC2-204ENST00000481565 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.81■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.8■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 PBRM1Q86U86 1689 aa43.77■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 ARHGEF11O15085 1522 aa43.76■■■■■ 4.6
ZIC2-204ENST00000481565 SYNJ2O15056 1496 aa43.74■■■■■ 4.59
ZIC2-204ENST00000481565 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.56■■■■■ 4.56
ZIC2-204ENST00000481565 ADAMTS12P58397 1594 aa43.43■■■■■ 4.54
ZIC2-204ENST00000481565 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.43■■■■■ 4.54
ZIC2-204ENST00000481565 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.42■■■■■ 4.54
ZIC2-204ENST00000481565 GRIN2AQ12879 1464 aa43.39■■■■■ 4.54
ZIC2-204ENST00000481565 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.38■■■■■ 4.53
ZIC2-204ENST00000481565 ARAP1Q96P48 1450 aa43.38■■■■■ 4.53
ZIC2-204ENST00000481565 NUP160Q12769 1436 aa43.22■■■■■ 4.51
ZIC2-204ENST00000481565 CEP170Q5SW79 1584 aa43.18■■■■■ 4.5
ZIC2-204ENST00000481565 KIF27Q86VH2 1401 aa43.14■■■■■ 4.5
ZIC2-204ENST00000481565 IGF1RP08069 1367 aa43.03■■■■■ 4.48
ZIC2-204ENST00000481565 SHROOM2Q13796 1616 aa42.92■■■■■ 4.46
ZIC2-204ENST00000481565 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.91■■■■■ 4.46
ZIC2-204ENST00000481565 CUL7Q14999 1698 aa42.89■■■■■ 4.46
ZIC2-204ENST00000481565 JPH4Q96JJ6 628 aa42.81■■■■■ 4.44
ZIC2-204ENST00000481565 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms