RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378332.6

ANKRD11-204, Transcript of ankyrin repeat domain 11, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD11, Length 1,982 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD11-204ENST00000378332 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.72■■■■■ 5.23
ANKRD11-204ENST00000378332 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.57■■■■■ 4.24
ANKRD11-204ENST00000378332 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
ANKRD11-204ENST00000378332 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.48■■■■□ 3.91
ANKRD11-204ENST00000378332 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.41■■■■□ 3.9
ANKRD11-204ENST00000378332 ABCC9O60706 1549 aa39.32■■■■□ 3.89
ANKRD11-204ENST00000378332 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.08■■■■□ 3.85
ANKRD11-204ENST00000378332 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.89■■■■□ 3.82
ANKRD11-204ENST00000378332 NACADO15069 1562 aa38.69■■■■□ 3.78
ANKRD11-204ENST00000378332 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.36■■■■□ 3.73
ANKRD11-204ENST00000378332 SCRIBQ14160 1630 aa38.32■■■■□ 3.72
ANKRD11-204ENST00000378332 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.65■■■■□ 3.62
ANKRD11-204ENST00000378332 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
ANKRD11-204ENST00000378332 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.23■■■■□ 3.55
ANKRD11-204ENST00000378332 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.11■■■■□ 3.53
ANKRD11-204ENST00000378332 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.11■■■■□ 3.53
ANKRD11-204ENST00000378332 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
ANKRD11-204ENST00000378332 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.9■■■■□ 3.5
ANKRD11-204ENST00000378332 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
ANKRD11-204ENST00000378332 SMARCA4P51532 1647 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD11-204ENST00000378332 WIZO95785 1651 aa36.63■■■■□ 3.46
ANKRD11-204ENST00000378332 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
ANKRD11-204ENST00000378332 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.2■■■■□ 3.38
ANKRD11-204ENST00000378332 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
ANKRD11-204ENST00000378332 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.05■■■■□ 3.36
ANKRD11-204ENST00000378332 SMARCA2P51531 1590 aa36.02■■■■□ 3.36
ANKRD11-204ENST00000378332 CHIC1Q5VXU3 224 aa36■■■■□ 3.35
ANKRD11-204ENST00000378332 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ANKRD11-204ENST00000378332 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD11-204ENST00000378332 NCAPD3P42695 1498 aa35.7■■■■□ 3.31
ANKRD11-204ENST00000378332 HMGXB3Q12766 1538 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKRD11-204ENST00000378332 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKRD11-204ENST00000378332 TRIM41Q8WV44 630 aa35.33■■■■□ 3.25
ANKRD11-204ENST00000378332 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.26■■■■□ 3.24
ANKRD11-204ENST00000378332 ABCC8Q09428 1581 aa35.17■■■■□ 3.22
ANKRD11-204ENST00000378332 CFTRP13569 1480 aa34.95■■■■□ 3.19
ANKRD11-204ENST00000378332 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.182e-6■■■□□ 16.7
ANKRD11-204ENST00000378332 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.82■■■■□ 3.16
ANKRD11-204ENST00000378332 PRDM2Q13029 1718 aa34.8■■■■□ 3.16
ANKRD11-204ENST00000378332 SYNJ1O43426 1573 aa34.77■■■■□ 3.16
ANKRD11-204ENST00000378332 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ANKRD11-204ENST00000378332 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.67■■■■□ 3.14
ANKRD11-204ENST00000378332 TOP2BQ02880 1626 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD11-204ENST00000378332 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.56■■■■□ 3.12
ANKRD11-204ENST00000378332 NESP48681 1621 aa34.54■■■■□ 3.12
ANKRD11-204ENST00000378332 SOGA1O94964 1423 aa34.5■■■■□ 3.11
ANKRD11-204ENST00000378332 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.5■■■■□ 3.11
ANKRD11-204ENST00000378332 CUX1P39880 1505 aa34.49■■■■□ 3.11
ANKRD11-204ENST00000378332 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.46■■■■□ 3.11
ANKRD11-204ENST00000378332 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD11-204ENST00000378332 EEA1Q15075 1411 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD11-204ENST00000378332 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.3■■■■□ 3.08
ANKRD11-204ENST00000378332 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.23■■■■□ 3.07
ANKRD11-204ENST00000378332 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.23■■■■□ 3.07
ANKRD11-204ENST00000378332 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.22■■■■□ 3.07
ANKRD11-204ENST00000378332 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.15■■■■□ 3.06
ANKRD11-204ENST00000378332 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.14■■■■□ 3.06
ANKRD11-204ENST00000378332 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
ANKRD11-204ENST00000378332 TOPBP1Q92547 1522 aa34.09■■■■□ 3.05
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ANKRD11-204ENST00000378332 KIF27Q86VH2 1401 aa33.99■■■■□ 3.03
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ANKRD11-204ENST00000378332 GOLGA3Q08378 1498 aa33.95■■■■□ 3.03
ANKRD11-204ENST00000378332 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
ANKRD11-204ENST00000378332 CUX2O14529 1486 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD11-204ENST00000378332 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.85■■■■□ 3.01
ANKRD11-204ENST00000378332 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.84■■■■□ 3.01
ANKRD11-204ENST00000378332 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
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ANKRD11-204ENST00000378332 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.79■■■■□ 3
ANKRD11-204ENST00000378332 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.78■■■■□ 3
ANKRD11-204ENST00000378332 PRXQ9BXM0 1461 aa33.77■■■■□ 3
ANKRD11-204ENST00000378332 ERCC6Q03468 1493 aa33.75■■■□□ 2.99
ANKRD11-204ENST00000378332 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.71■■■□□ 2.99
ANKRD11-204ENST00000378332 CEP162Q5TB80 1403 aa33.7■■■□□ 2.99
ANKRD11-204ENST00000378332 WDR97A6NE52 1622 aa33.69■■■□□ 2.98
ANKRD11-204ENST00000378332 IGF1RP08069 1367 aa33.67■■■□□ 2.98
ANKRD11-204ENST00000378332 WDR62O43379 1518 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD11-204ENST00000378332 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
ANKRD11-204ENST00000378332 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
ANKRD11-204ENST00000378332 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.53■■■□□ 2.96
ANKRD11-204ENST00000378332 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.52■■■□□ 2.96
ANKRD11-204ENST00000378332 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
ANKRD11-204ENST00000378332 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.45■■■□□ 2.95
ANKRD11-204ENST00000378332 CUL7Q14999 1698 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD11-204ENST00000378332 CLIP1P30622 1438 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD11-204ENST00000378332 IFT140Q96RY7 1462 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD11-204ENST00000378332 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
ANKRD11-204ENST00000378332 PBRM1Q86U86 1689 aa33.29■■■□□ 2.92
ANKRD11-204ENST00000378332 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.29■■■□□ 2.922e-8■■■□□ 17
ANKRD11-204ENST00000378332 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
ANKRD11-204ENST00000378332 GRIN2BQ13224 1484 aa33.16■■■□□ 2.9
ANKRD11-204ENST00000378332 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.15■■■□□ 2.9
ANKRD11-204ENST00000378332 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
ANKRD11-204ENST00000378332 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.13■■■□□ 2.89
ANKRD11-204ENST00000378332 ARAP1Q96P48 1450 aa33.09■■■□□ 2.89
ANKRD11-204ENST00000378332 ADAMTS12P58397 1594 aa33.09■■■□□ 2.89
ANKRD11-204ENST00000378332 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.09■■■□□ 2.89
ANKRD11-204ENST00000378332 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
ANKRD11-204ENST00000378332 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
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