Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFP28Q8NHY6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP28Q8NHY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP28Q8NHY6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP28Q8NHY6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms