Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF555Q8NEP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF555Q8NEP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF555Q8NEP9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms