Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL4BQ8N7F7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL4BQ8N7F7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms