Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINQ8N4C6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINQ8N4C6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms