Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC43Q8N309 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRRC43Q8N309 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC43Q8N309 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms