Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARHGEF28Q8N1W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ARHGEF28Q8N1W1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
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