Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y46

KRT73, Keratin, type II cytoskeletal 73, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT73Q86Y46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT73Q86Y46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT73Q86Y46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT73Q86Y46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms