Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC84Q86UT8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC84Q86UT8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC84Q86UT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms