Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGAP27Q6ZUM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGAP27Q6ZUM4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARHGAP27Q6ZUM4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ARHGAP27Q6ZUM4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms