Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
WDR88Q6ZMY6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR88Q6ZMY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR88Q6ZMY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms