Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPTNQ6XPR3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPTNQ6XPR3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms