Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MUC6Q6W4X9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MUC6Q6W4X9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms