Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCBE1Q6UXH8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCBE1Q6UXH8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCBE1Q6UXH8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms