Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C16orf54Q6UWD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C16orf54Q6UWD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms