Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LETMD1Q6P1Q0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LETMD1Q6P1Q0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms