Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
EFCAB2Q5VUJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
EFCAB2Q5VUJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
EFCAB2Q5VUJ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
EFCAB2Q5VUJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
EFCAB2Q5VUJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms