Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf53Q5VUE5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
C1orf53Q5VUE5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C1orf53Q5VUE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf53Q5VUE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms