Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC39BQ5VTQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC39BQ5VTQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC39BQ5VTQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms