Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFTN2Q52LD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFTN2Q52LD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms