Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP13A4Q4VNC1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP13A4Q4VNC1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP13A4Q4VNC1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms