Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSGA10IPQ3SY00 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TSGA10IPQ3SY00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms