Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1BQ3KR37 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRAMD1BQ3KR37 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRAMD1BQ3KR37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms