Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EDRF1Q3B7T1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EDRF1Q3B7T1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EDRF1Q3B7T1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms