Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC142Q17RM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC142Q17RM4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC142Q17RM4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms