Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIF1AQ16665 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HIF1AQ16665 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIF1AQ16665 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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