Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF1CQ15572 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TAF1CQ15572 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF1CQ15572 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TAF1CQ15572 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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