Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYTH1Q15438 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYTH1Q15438 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH1Q15438 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
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