Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPTAN1Q13813 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPTAN1Q13813 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPTAN1Q13813 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms