Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RUNX3Q13761 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUNX3Q13761 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RUNX3Q13761 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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