Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYNC1I2Q13409 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYNC1I2Q13409 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DYNC1I2Q13409 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms