Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSMD2Q13200 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSMD2Q13200 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSMD2Q13200 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms