Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
REG3AQ06141 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REG3AQ06141 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms