Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD1Q02809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD1Q02809 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD1Q02809 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms