Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2BP67870 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2BP67870 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms