Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNG7P62955 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG7P62955 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNG7P62955 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms