Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATN1P54259 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATN1P54259 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATN1P54259 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATN1P54259 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATN1P54259 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATN1P54259 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATN1P54259 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATN1P54259 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATN1P54259 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATN1P54259 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATN1P54259 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATN1P54259 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATN1P54259 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATN1P54259 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATN1P54259 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATN1P54259 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATN1P54259 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATN1P54259 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATN1P54259 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATN1P54259 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATN1P54259 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATN1P54259 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATN1P54259 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATN1P54259 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATN1P54259 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATN1P54259 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATN1P54259 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATN1P54259 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATN1P54259 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATN1P54259 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATN1P54259 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATN1P54259 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATN1P54259 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATN1P54259 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATN1P54259 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATN1P54259 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATN1P54259 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATN1P54259 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATN1P54259 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATN1P54259 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms