Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 AC091167.3-201ENST00000561573 3838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.858e-10■■■■■ 44.8
SUB1P53999 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-13■■■■■ 44.7
SUB1P53999 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 33.76□□□□□ -1.812e-13■■■■■ 44.7
SUB1P53999 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 44.6
SUB1P53999 EIF3M-211ENST00000532054 532 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-14■■■■■ 44.5
SUB1P53999 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 44.4
SUB1P53999 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 44.4
SUB1P53999 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.752e-8■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-210ENST00000547555 1658 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-202ENST00000380135 1566 ntTSL 312.21□□□□□ -0.463e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.473e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-209ENST00000547318 2001 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.53e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-212ENST00000547877 2020 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-234ENST00000552645 1623 ntTSL 1 (best)7.64□□□□□ -1.193e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 LETMD1-238ENST00000623495 2948 nt5.43□□□□□ -1.543e-10■■■■■ 44.4
SUB1P53999 HINT1-203ENST00000506207 369 ntTSL 54.18□□□□□ -1.746e-8■■■■■ 44.4
SUB1P53999 PSMD14-205ENST00000492908 1786 ntTSL 22.28□□□□□ -2.043e-8■■■■■ 44.3
SUB1P53999 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)1.58□□□□□ -2.163e-8■■■■■ 44.3
SUB1P53999 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-12■■■■■ 44.3
SUB1P53999 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-11■■■■■ 44.3
SUB1P53999 DARS-209ENST00000478212 892 ntTSL 23.07□□□□□ -1.922e-9■■■■■ 44.3
SUB1P53999 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 44.3
SUB1P53999 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 ATP6AP2-231ENST00000637955 1084 ntTSL 55.98□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 44.1
SUB1P53999 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-16■■■■■ 44.1
SUB1P53999 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.62e-16■■■■■ 44.1
SUB1P53999 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-16■■■■■ 44.1
SUB1P53999 MAD2L1-203ENST00000504707 764 ntTSL 212.25□□□□□ -0.453e-33■■■■■ 44.1
SUB1P53999 MAD2L1-204ENST00000511295 528 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-33■■■■■ 44.1
SUB1P53999 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 44.1
SUB1P53999 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 44.1
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SUB1P53999 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 26.12□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 44.1
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SUB1P53999 CHURC1-FNTB-202ENST00000551823 517 ntTSL 21.9□□□□□ -2.119e-7■■■■■ 44
SUB1P53999 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -13e-9■■■■■ 43.8
SUB1P53999 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.47e-8■■■■■ 43.7
SUB1P53999 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 314.75□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 43.7
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SUB1P53999 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.97e-8■■■■■ 43.7
SUB1P53999 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 43.7
SUB1P53999 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-218ENST00000543939 1728 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 43.7
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SUB1P53999 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.937e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.477e-7■■■■■ 43.7
SUB1P53999 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.839e-20■■■■■ 43.7
SUB1P53999 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt16.17■□□□□ 0.182e-31■■■■■ 43.6
SUB1P53999 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-31■■■■■ 43.6
SUB1P53999 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-31■■■■■ 43.6
SUB1P53999 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-31■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-208ENST00000559153 1918 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.811e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 STAT2-207ENST00000556539 3278 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.877e-8■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.891e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-209ENST00000559291 6131 ntTSL 59.12□□□□□ -0.951e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-202ENST00000416810 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-203ENST00000558113 576 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.421e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.421e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.421e-17■■■■■ 43.6
SUB1P53999 SEC11A-206ENST00000558924 3626 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.853e-19■■■■■ 43.6
SUB1P53999 SEC11A-207ENST00000559376 2204 nt8.42□□□□□ -1.063e-19■■■■■ 43.6
SUB1P53999 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 MAD2L1-202ENST00000333047 1277 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 43.5
SUB1P53999 CHURC1-201ENST00000547625 326 ntTSL 3-2.23□□□□□ -2.777e-7■■■■■ 43.4
SUB1P53999 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 43.3
SUB1P53999 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 43.3
SUB1P53999 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 43.3
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