Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRCA2P51587 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRCA2P51587 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRCA2P51587 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms