Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSRP3P50461 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSRP3P50461 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms