Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNT3P45378 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT3P45378 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT3P45378 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms