Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNFP41002 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNFP41002 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNFP41002 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNFP41002 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNFP41002 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNFP41002 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNFP41002 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNFP41002 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNFP41002 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNFP41002 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNFP41002 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNFP41002 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNFP41002 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNFP41002 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNFP41002 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNFP41002 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNFP41002 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNFP41002 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNFP41002 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNFP41002 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNFP41002 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNFP41002 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNFP41002 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms