Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FLT4P35916 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FLT4P35916 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FLT4P35916 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FLT4P35916 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FLT4P35916 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FLT4P35916 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FLT4P35916 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FLT4P35916 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FLT4P35916 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FLT4P35916 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FLT4P35916 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FLT4P35916 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FLT4P35916 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FLT4P35916 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FLT4P35916 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
FLT4P35916 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
FLT4P35916 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FLT4P35916 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FLT4P35916 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FLT4P35916 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FLT4P35916 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FLT4P35916 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FLT4P35916 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FLT4P35916 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FLT4P35916 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FLT4P35916 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FLT4P35916 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FLT4P35916 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FLT4P35916 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FLT4P35916 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FLT4P35916 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FLT4P35916 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FLT4P35916 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FLT4P35916 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FLT4P35916 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FLT4P35916 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FLT4P35916 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FLT4P35916 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FLT4P35916 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FLT4P35916 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FLT4P35916 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FLT4P35916 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FLT4P35916 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FLT4P35916 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FLT4P35916 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms