Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATP7BP35670 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATP7BP35670 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ATP7BP35670 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms