Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD11P31277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD11P31277 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD11P31277 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms