Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMA3P25788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMA3P25788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA3P25788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms