Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP6V1C1P21283 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP6V1C1P21283 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP6V1C1P21283 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms