Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF7P17544 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF7P17544 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF7P17544 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF7P17544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF7P17544 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF7P17544 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF7P17544 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF7P17544 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF7P17544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF7P17544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF7P17544 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF7P17544 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF7P17544 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF7P17544 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF7P17544 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF7P17544 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF7P17544 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF7P17544 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF7P17544 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF7P17544 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF7P17544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF7P17544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF7P17544 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF7P17544 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF7P17544 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF7P17544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF7P17544 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF7P17544 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF7P17544 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF7P17544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF7P17544 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF7P17544 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF7P17544 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF7P17544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF7P17544 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF7P17544 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF7P17544 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF7P17544 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF7P17544 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF7P17544 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF7P17544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF7P17544 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF7P17544 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF7P17544 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF7P17544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF7P17544 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF7P17544 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF7P17544 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF7P17544 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF7P17544 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF7P17544 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATF7P17544 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF7P17544 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF7P17544 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF7P17544 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF7P17544 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF7P17544 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF7P17544 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATF7P17544 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATF7P17544 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms